Desperado, v49 güncellemesiyle oyuna katılan yeni bir maymundur. Desperado'nun kilidi, 3.500.000 Bloon patlatıldıktan sonra ücretsiz olarak açılır. Bu yeni maymun, çeşitli saldırı tarzları sunan üç farklı yükseltme yoluna sahiptir:
Üst Yol: Mesafeyi ve atış hızını artıran, hızla çekilen altıpatlarlar. Bu silah, inanılmaz hızlarda atış yapan "Parlayan Güneş" ile doruğa ulaşır.
Alt Yol: Bloon'ları patlatan ve pasif can hasarını azaltmanın yanı sıra kaçışlardan nakit kurtarma özelliği sunan saçma mermileri içeren, kısa menzilli Alaybozan. Bu silah gelişerek "Çöl Hayaleti"ne dönüşür.
Orta Yol: Uzak mesafeden kritik vuruş olasılığını yükselten, nakit ödüllerini ve hasarı artıran bir ödül mekanizması sunan uzun menzilli bir Tüfek. Bu tüfek gelişerek "Altın Adalet"e dönüşür.
Yeni orta yol yetenekleri şunlardır:
Nişan Alma: Herhangi bir hedef maymuna kısa süreliğine Kamuflajlı Tespiti, menzil artışı ve gelişmiş isabet sağlar. Daha ileri yükseltmeler, ek Bloon patlatma yeteneklerine olanak tanır
Patlatılmak Üzere İşaretlendi: Ekstra ödül hedeflerini hızlıca işaretler, ardından mümkün olduğunca çok sayıda işaretli hedefi patlatır.